| 図鑑No. | 名前 | タイプ1 | タイプ2 |
| 003 |  メガフシギバナ | くさ | どく |
| 006 |  メガリザードンX | ほのお | ドラゴン |
| 006 |  メガリザードンY | ほのお | ひこう |
| 009 |  メガカメックス | みず | |
| 015 |  メガスピアー | むし | どく |
| 018 |  メガピジョット | ノーマル | ひこう |
| 065 |  メガフーディン | エスパー | |
| 080 |  メガヤドラン | みず | エスパー |
| 094 |  メガゲンガー | ゴースト | どく |
| 115 |  メガガルーラ | ノーマル | |
| 127 |  メガカイロス | むし | ひこう |
| 130 |  メガギャラドス | みず | あく |
| 142 |  メガプテラ | いわ | ひこう |
| 150 |  メガミュウツーX | エスパー | かくとう |
| 150 |  メガミュウツーY | エスパー |
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